Para que possa alterar o CST de algum tipo de peça ou de um NCM, você deve seguir o caminho abaixo:
Suprimentos -> Estoque -> Manutencao -> Altera Cod.Tributac.
Feito isso você deve informar o tipo de peça ou teclando ENTER você irá informar o NCM e então informar o CST que deseja vincular ao mesmo:
